基因组减少的细菌

申请公布号：

CN1620497B

申请号：

CN03802545.0

申请日期：

2003.01.22

申请公布日期：

2014.11.19

申请人：

威斯康星校友研究基金会

发明人：

F·R·布拉特纳;G·波斯发;C·D·赫林;G·普伦基特;J·D·格兰斯纳;T·M·托斯

分类号：

C12N1/20(2006.01)I;C12N15/70(2006.01)I

主分类号：

C12N1/20(2006.01)I

代理机构：

北京集佳知识产权代理有限公司 11227

代理人：

顾晋伟;卢蓓

地址：

美国威斯康星州

摘要：

本发明提供一种细菌，所具有的基因组被遗传改造成比其天然亲代菌株基因组小至少2到约20％。具较小基因组的细菌可更有效生成商业产品。本发明也提供从细菌基因组缺失基因和其它DNA序列的方法。此方法提供精确的缺失且很少引入突变到缺失位置周围的基因组DNA序列。因此，该方法可用于产生一系列细菌中的突变而不增加基因组内不需要的同源重组的可能性。此外，本发明提供的一些方法也能用于使所需DNA序列取代细菌基因组区域。

主权项：

一种大肠杆菌，所述大肠杆菌的基因组被遗传改造成比其天然亲代大肠杆菌菌株K12MG1655基因组小5％至20％，其中从所述细菌基因组缺失的序列不会不利地影响细菌在特定生长条件下生存和增殖的速度， 其中所述大肠杆菌的基因组缺失了以下基因： 263080‑324632(MD1)，1398351‑1480278(MD2)，2556711‑2563500(MD3)，2754180‑2789270(MD4)，2064327‑2078613(MD5)，3451565‑3467490(MD6)，2464565‑2474198(MD7)，1625542‑1650785(MD8)，4494243‑4547279(MD9)，3108697‑3134392(MD10)，1196360‑1222299(MD11)，564278‑585331(MD12)，15388‑20562(GP1)，602688‑608572(GP2)，2507651‑2515959(GP3)，379334‑387870(GP4)，389122‑399029(GP5)，2993014‑2996890(GP6)，3182797‑3189712(GP7)，687083‑688267(GP8)，1386912‑1396645(GP9)，2099418‑2135738(GP10)，2284421‑2288200(GP11)，3359797‑3365277(GP12)，3648921‑3651342(GP13)，1128620‑1140209(GP14)，1960590‑1977353(GP15)，1995135‑2021700(GP16)，4553059‑4594581(GP17)，522062‑529349(GP18)，728588‑738185(GP19)，1525916‑1531650(GP20)，3616623‑3623310(GP21)，3759620‑3767869(GP22)，1041254‑1049768(GP23)，1085330‑1096545(GP24)，2163173‑2175230(GP25)，3578769‑3582673(GP26)，3718263‑3719704(GP27)，和167484‑173447(MD40)。